Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3727J3QM54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3727J3QM54 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3727J3QM54 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3727J3QM54 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm3727J3QM54 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm3727J3QM54 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm3727J3QM54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3727J3QM54 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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