Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20830J3KML6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20830J3KML6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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