Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn20G5E8X0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn20G5E8X0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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