Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Speer4cG3UXD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Speer4cG3UXD1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms