Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Urb2E9Q7L1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Urb2E9Q7L1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms