Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r174E9PYW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r174E9PYW5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms