Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl3lE9PWZ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl3lE9PWZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms