Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc144bE9PVZ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms