Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syde2E9PUP1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms