Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc8D3YZV8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms