Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clip3B9EHT4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms