Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11cB4XVP9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf11cB4XVP9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms