Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm436B1AVU6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm436B1AVU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms