Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M5A7VMS3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M5A7VMS3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M5A7VMS3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M5A7VMS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-M5A7VMS3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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H2-M5A7VMS3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2-M5A7VMS3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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