Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AI481877A2ALV5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
AI481877A2ALV5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AI481877A2ALV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms