Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
4930447F04RikA2AFR2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
4930447F04RikA2AFR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930447F04RikA2AFR2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
4930447F04RikA2AFR2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms