Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms