Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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