Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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OtofQ9ESF1 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
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OtofQ9ESF1 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
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OtofQ9ESF1 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
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OtofQ9ESF1 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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OtofQ9ESF1 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
OtofQ9ESF1 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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