Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ctnna3Q65CL1 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms