Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Ccl20O89093 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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Ccl20O89093 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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Ccl20O89093 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Ccl20O89093 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms