Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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