Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Dsg1bQ7TSF1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Dsg1bQ7TSF1 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms