Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Traf3ip1Q149C2 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms