Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mbd2Q9Z2E1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms