Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms