Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Shcbp1Q9Z179 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Shcbp1Q9Z179 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms