Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sema4fQ9Z123 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema4fQ9Z123 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms