Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itgb6Q9Z0T9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itgb6Q9Z0T9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms