Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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