Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col4a4Q9QZR9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col4a4Q9QZR9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms