Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ChmlQ9QZD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChmlQ9QZD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms