Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms