Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Snai3Q9QY31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Snai3Q9QY31 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms