Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip4Q9QXN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms