Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tcea2Q9QVN7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms