Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJL0

Tsga8, Testis-specific gene A8 protein, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga8Q9JJL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsga8Q9JJL0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tsga8Q9JJL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Tsga8Q9JJL0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tsga8Q9JJL0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tsga8Q9JJL0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsga8Q9JJL0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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