Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pus3Q9JI38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pus3Q9JI38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms