Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn12Q9ET43 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn12Q9ET43 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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