Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ParvgQ9ERD8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ParvgQ9ERD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms