Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Capn12Q9ER56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms