Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef4Q9EQZ6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef4Q9EQZ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms