Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chst1Q9EQC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst1Q9EQC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms