Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aph1cQ9DCZ9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aph1cQ9DCZ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms