Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap3s1Q9DCR2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap3s1Q9DCR2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms