Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Eif3fQ9DCH4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms