Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp2aQ9DB34 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp2aQ9DB34 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms