Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9DA42 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9DA42 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9DA42 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9DA42 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9DA42 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9DA42 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DA42 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DA42 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DA42 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DA42 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms