Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp12Q9D9M2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms