Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldnd2Q9D9H2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms